水系微孔滤膜：适用水溶液，水系，不耐有机溶剂。如：混合纤维素酯膜。
有机系微孔滤膜：适用有机溶液等。如：偏氟膜，由聚偏氟乙烯树脂制成，为疏水性滤膜，适用于有机溶剂及空气过滤。
而尼龙膜是通用型，满足纯水样品和水/有机混合样品等

0.45微米除颗粒和大多数细菌微生物，0.22微米可以达到GMP或者药典规定的除菌99.99%的要求。